稀有程度评价
内容的多样化，洞窟形制的独特是森木塞姆石窟所独有的，并在晚期之洞窟中出现了汉风和回鹘风壁画。这无疑对研究古代建筑、中国石窟艺术和中西方文化交流具有极高的史料价值。
保护范围
东至东区石窟群外910～960米处冲沟；西至西区石窟群外800～1000米处山脊；南至南区石窟群外400米处山脊；北至北区石窟群外610～690米处山脊。
建设控制地带
东界：北起却勒塔格山的分水岭向南经泄洪沟至克日希村北面的防洪坝（距保护范围东 界1600米）。
西界：北起却勒塔格山的分水岭向南经泄洪沟至克日希村北面的防洪坝（距保护范围西 界1200米） 。
南界：克日希村北面的防洪坝。
北界：石窟北面却勒塔格山的最高峰的分水岭。
保护管理要求
1.禁止在保护范围内存放易燃易爆、放射性物品，有毒和腐蚀性物品以及其他危害森木塞姆石窟安全的物品。禁止向保护范围内排放污染物。
2.禁止在保护范围内取土、修渠、放牧、采石、爆破以及进行其他危害森木塞姆石窟安全的活动。
3.在森木塞姆石窟保护范围内进行工程建设的，依照有关法律法规的规定上报批准。
4.在建设控制地带新建或者改建建筑物和构筑物的，其设计方案应当征得自治区文物行政主管部门的同意。
5.对石窟进行修缮，应当尽量保持石窟现存外貌。对壁画、塑像等文物进行修复，应当遵守修旧如旧、不改变原状的原则。
6.洞窟壁画、塑像及馆藏文物的保护管理以及出入库、提取使用等活动，严格按照各项管理制度进行，防止文物流失或者损坏。
保护大事记
2008年3月18日：库车县颁布《森木塞姆石窟保护管理暂行办法》。
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